石德順研究員團(tuán)隊(duì)揭示水牛胚胎基因組激活(EGA)機(jī)制

2023/07/16 20:03    閱讀:

2023年7月,我院石德順研究員團(tuán)隊(duì)在國(guó)際top期刊《Journal of Animal Science and Biotechnology》(中科院一區(qū),IF=7.0)在線發(fā)表了題為“Whole-genome transcriptome and DNA methylation dynamics of pre-implantation embryos reveal progression of embryonic genome activation in buffaloes”的研究成果,首次從全基因組轉(zhuǎn)錄和DNA甲基化水平揭示了水牛早期胚胎發(fā)育進(jìn)程,并揭示了胚胎基因組激活(EGA)機(jī)制。

水牛早期胚胎在體外培養(yǎng)發(fā)育率較低,容易發(fā)生發(fā)育阻滯現(xiàn)象,這極大的限制了水牛胚胎生物技術(shù)在水牛產(chǎn)業(yè)發(fā)展中的應(yīng)用。因此,闡明水牛早期胚胎發(fā)育規(guī)律及EGA分子調(diào)控機(jī)制具有重要意義。本研究運(yùn)用微量細(xì)胞RNA-Seq和WGBS技術(shù),首次構(gòu)建了水牛卵母細(xì)胞和早期胚胎全基因組轉(zhuǎn)錄圖譜和DNA甲基化圖譜,揭示了水牛早期胚胎進(jìn)程,從全基因組水平明確了水牛Major EGA發(fā)生在16-cell階段,通過(guò)WGCNA分析進(jìn)一步闡述了水牛EGA的調(diào)控機(jī)制,明確了相關(guān)調(diào)控通路和重要hubgene,并且發(fā)現(xiàn)CDK1基因通過(guò)細(xì)胞周期、細(xì)胞分裂、磷酸化和蛋白質(zhì)定位到核等細(xì)胞分子生物過(guò)程對(duì)水牛胚胎EGA起到了關(guān)鍵性作用。

本研究工作以廣西大學(xué)為第一通訊單位,廣西大學(xué)石德順研究員和中國(guó)農(nóng)科院深圳基因所高飛研究員為通訊作者,伏彭輝博士為第一作者,楊春艷博士、袁翔博士均參與了重要工作。該研究同時(shí)得到了劉慶友教授和崔奎青教授的傾心指導(dǎo)。項(xiàng)目得到國(guó)家自然基金項(xiàng)目和廣西八桂學(xué)者創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目資助。

 

全文鏈接:https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-023-00894-5

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