石德順研究員團(tuán)隊(duì)揭示水牛肌肉發(fā)育遺傳機(jī)制取得新進(jìn)展

2021/07/01 14:17    閱讀:


近日,Molecular Therapy-Nucleic AcidsIF=8.886Top 10%在線發(fā)表廣西大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院石德順研究員團(tuán)隊(duì)完成的題為“Circular RNA circMYBPC1 promotes skeletal muscle differentiation by targeting MyHC”研究論文(全文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.omtn.2021.03.004)。系統(tǒng)介紹了團(tuán)隊(duì)在水牛肌肉發(fā)育機(jī)制方面的取得的重要研究進(jìn)展,具體研究如下:

水牛具有適應(yīng)性強(qiáng)、抗病力強(qiáng)、耐粗飼等特點(diǎn),特別適合我國(guó)南方亞熱帶地區(qū)飼養(yǎng)。根據(jù)聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)統(tǒng)計(jì),2020 年全世界存養(yǎng)水牛約2.3 億頭,全球有20 億人依靠家養(yǎng)水牛所提供的奶肉產(chǎn)品和役力而生活,水牛被FAO 譽(yù)為“最具開(kāi)發(fā)潛能”和“養(yǎng)活世界人口最多的大家畜”。我國(guó)是世界上第三大水牛養(yǎng)殖國(guó),南方18 省共存欄2744 萬(wàn)頭,約占全國(guó)牛總存欄數(shù)的20%。隨著我國(guó)農(nóng)業(yè)機(jī)械化程度的快速提高,水牛的役用價(jià)值逐漸減小,如何開(kāi)發(fā)利用這一龐大的畜種資源,形成獨(dú)具特色的肉牛業(yè),是國(guó)家面臨的一個(gè)重要課題。因此,充分開(kāi)發(fā)水牛肉用性能,進(jìn)一步增加牛肉產(chǎn)量,提高牛肉品質(zhì),已成為當(dāng)前水牛育種的重要任務(wù)之一。

探究circRNAmiRNA調(diào)控肌肉發(fā)育的作用機(jī)制是當(dāng)前肉牛繁育的研究熱點(diǎn)。本團(tuán)隊(duì)首次以廣西本地沼澤型水牛為研究對(duì)象,以不同發(fā)育時(shí)期的水牛肌肉樣本為研究對(duì)象,采用RNA-Seq技術(shù)對(duì)其進(jìn)行circRNA測(cè)序,發(fā)現(xiàn)新非編碼RNA-circRNA0007120在成年時(shí)期肌肉中高表達(dá),該circRNA全長(zhǎng)398 nt,采用RNA-FISH技術(shù)發(fā)現(xiàn)主要定位于成肌細(xì)胞細(xì)胞質(zhì),在發(fā)育過(guò)程中隨著分化逐漸高表達(dá)。提示該轉(zhuǎn)錄本可能與成肌細(xì)胞分化有關(guān),該circRNA來(lái)源于肌凝蛋白結(jié)合蛋白基因MYBPC1, 因此將其命名為circMYBPC1, 進(jìn)一步通過(guò)RIPRNA pull down等技術(shù)探索circMYBPC1miRNAmRNARBP(RNA Binding Protein)形成機(jī)制及功能驗(yàn)證,結(jié)果表明:circMYBPC1可以通過(guò)吸附miR-23a,減弱miR-23a對(duì)MyHC基因表達(dá)的抑制作用,circMYBPC1可以結(jié)合MyHC蛋白,進(jìn)而增強(qiáng)水牛成肌細(xì)胞分化作用;最終小鼠肌損傷實(shí)驗(yàn)表明,circMYBPC1還可能促進(jìn)肌再生機(jī)制的發(fā)生,最終提出circMYBPC1調(diào)控水牛肌肉發(fā)育的調(diào)控分子機(jī)制模型。

該研究工作以廣西大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院為第一單位。廣西大學(xué)石德順研究員和李輝助理教授為本文的共同通訊作者,2020級(jí)博士生陳孟杰為本文第一作者。項(xiàng)目得到廣西科技重大專項(xiàng)批準(zhǔn)號(hào)AA17204051);國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目批準(zhǔn)號(hào)31802043)廣西研究生教育創(chuàng)新項(xiàng)目YCSW2019027 YCSW2019028的資助。

石德順研究員團(tuán)隊(duì)一直從事水牛功能基因組與轉(zhuǎn)錄組的研究,不僅在測(cè)序數(shù)據(jù)的分析方面積累了豐富的經(jīng)驗(yàn),而且在基因功能研究方面建立了一套研究方法,目前已建立了調(diào)控牛肌肉發(fā)育的非編碼RNA庫(kù),為我國(guó)水牛精準(zhǔn)肉用選育提供新的分子靶標(biāo)。近幾年,李輝博士專注于水牛三維基因組學(xué)研究,探索非編碼DNA調(diào)控元件對(duì)水牛基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的影響,鑒定并解析了一批影響水牛肌肉發(fā)育的調(diào)控元件和非編碼RNA,同時(shí)構(gòu)建水牛肌肉三維基因轉(zhuǎn)錄的精確調(diào)控網(wǎng)絡(luò),系統(tǒng)揭示水牛肉質(zhì)發(fā)育機(jī)理。

 




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